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第七届郭可信电子显微学和晶体学暑期学校举办

 [导读] 2014年7月26日-27日,“第七届郭可信电子显微学和晶体学暑期学校”在中国科学院上海生命科学研究院生化与细胞所/国家蛋白质科学中心.上海(筹)举办。
郭可信先生是我国著名的电子显微学和晶体学家,在国内率先引入高分辨电子显微镜,开始从原子尺度直接观察晶体结构的研究。郭可信先生为我国的金属材料物理研究以及电子显微学研究事业培养了大量的人才,桃李满天下。为继承郭可信先生的遗志,为中国电子显微学的持续发展做贡献,2008年由郭可信先生的学生倡导发起,国内外从事电镜研究应用的华人学者经过认真商讨,决定每年举办一次郭可信电子显微学和晶体学暑期学校,并以材料科学和生物学应用为主题轮流举行。

  2014年7月26日-27日,“第七届郭可信电子显微学和晶体学暑期学校”在中国科学院上海生命科学研究院生化与细胞所/国家蛋白质科学中心•上海(筹)举办。本期暑期学校为“2014冷冻电镜(cryo-EM)三维分子成像国际研讨会”的一个组成部分,着眼于冷冻电镜相关实验技术及计算软件的实践技术培训,旨在培养我国生物冷冻电镜高技术人才及年轻后备人才,加强我国在这一领域的科研实力。

  根据冷冻电镜的技术特点,本期暑期学校分为了电镜操作技术培训和图像处理技术培训两个部分。邀请了来自海外的知名专家学者进行讲授培训。

  电镜操作技术培训

  冷冻电镜技术作为结构生物学及细胞生物学的新兴研究方法,在过去十几年里技术上取得了长足的发展,最近几年在国内也得以推广并取得极大进步,越来越多的研究小组关注这一技术的应用。

加州大学旧金山分校 程亦凡博士

  来自加州大学旧金山分校的程亦凡博士介绍了冷冻电镜的基本原理、仪器构造、生物样品制备、三维重构的原理、以及电子晶体学、单颗粒三维重构、电子断层三维重构技术的特点与应用等内容。

布兰迪斯大学 徐晨博士

  布兰迪斯大学的徐晨博士从冷冻电镜设施的建立、冷冻电镜样品的制备和操作,以及当前电镜操作的自动化、远程控制等先进技术。最后,徐晨还介绍了新型图像探测器—直接电子探测器的市场和应用情况。

 

匹兹堡大学医学院 Peijun Zhang博士

  匹兹堡大学医学院的Peijun Zhang博士介绍了共聚焦显微镜与冷冻电镜结合使用在活细胞检测方面的应用。

美国斯克利普斯研究所 Anchi Cheng博士

  来自美国斯克利普斯研究所的Anchi Cheng博士介绍了其参与研发的Leginon电镜数据自动收集的软件与方法。Leginon是目前应用比较成熟的单颗粒自动化数据收集软件之一。

霍华德•休斯医学研究所 Dan Shi博士

  此外,还有来自霍华德•休斯医学研究所的Dan Shi博士介绍了电子衍射数据收集的相关内容。

  图像处理技术培训

  虽然近年来冷冻电镜技术进入快速发展期,然而与其配套的图像处理及三维重构技术在国内发展还相对滞后,一定程度上制约了该技术在我国的应用。此次培训班专门开设了电镜数据图像处理及三维重构技术课程,帮助学员系统全面地掌握最新的冷冻电镜图像处理技术和软件。

美国Baylor医学院 Steven Ludtke博士

  EMAN2的开发者——美国Baylor医学院的Steven Ludtke博士介绍了单颗粒冷冻电镜三维重构软件EMAN2。1999年,Steven Ludtke博士等人推出了EMAN软件的第一个版本,如今EMAN已成为世界上使用最广泛、用于高分辨率单颗粒重构的软件之一。

英国剑桥MRC分子生物学实验室 Sjors Scheres博士

  英国剑桥MRC分子生物学实验室的Sjors Scheres博士介绍了RELION软件包,以及最大概然统计分析理论和贝叶斯理论在电镜图像分析和三维重构中的应用。在最近解析的高分辨率电镜结构中,很多应用了RELION软件包。

 

德国Jülich研究中心 Gunnar Schroder博士

  德国Jülich研究中心的Gunnar Schroder博士介绍了DireX软件包在电镜三维密度图限制下柔性建模、分析评估方法及其软件的发展与应用。

图像处理技术培训现场

电镜操作技术培训现场

  在整个培训期间,除了邀请专家进行授课培训外,还安排了充分的时间让学员进行实际操作培训,并由授课老师直接进行指导。接受培训的学生们表示通过此次培训对于冷冻电镜及三维重构技术有了更深入的了解和认识,对于自己日后的研究工作颇有帮助。

  附录:郭可信电子显微学和晶体学暑期学校的由来

  郭可信先生是我国著名的电子显微学和晶体学家,在国内率先引入高分辨电子显微镜,开始从原子尺度直接观察晶体结构的研究。郭可信先生与钱临照、柯俊先生等科学家发起创建了中国电子显微镜学会,并亲任理事长。同时郭先生在国际科学界具有重要影响,曾任亚太地区电子显微学会联合会主席等,并且郭可信先生为我国的金属材料物理研究以及电子显微学研究事业培养了大量的人才,桃李满天下。

  为继承郭可信先生的遗志,为中国电子显微学的持续发展做贡献,2008年由郭可信先生的学生倡导发起,国内外从事电镜研究应用的华人学者经过认真商讨,决定每年举办一次郭可信电子显微学和晶体学暑期学校,并以材料科学和生物学应用为主题轮流举行。每年的暑期学校都电镜学习培训班和学术研讨会相结合的形式,一方面培养大家的电镜基础知识和操作技术,另一方面能够更好的了解国内外电镜应用的最新研究进展。

  首届郭可信电子显微学和晶体学暑期学校在清华大学举行,并举办“冷冻电镜三维分子成像国际研讨会”。此后,为了有系统持续性地推动冷冻电镜研究领域的交流与发展,加强我国科研的国际交流合作,使青年学者有机会与该领域权威科学家面对面交流,并得到高层次的培训,在中国每两年举办一次生物领域的“郭可信电子显微学与晶体学暑期学校”及“冷冻电镜三维分子成像国际研讨会”,第二届会议2010年在中科院生物物理所举办;第三届会议2012年在中国科技大学举办。

(撰稿:秦丽娟)


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